Neumonía asociada a ventilación mecánica en pacientes con neumonía grave por SARS-CoV-2 / Ventilation associated pneumonia in patients with severe SARS-CoV-2 pneumonia

Introducción: Los pacientes con COVID-19 pueden evolucionar hacia una falla respiratoria aguda grave y requerir ventilación mecánica invasiva (VMI). La complicación más frecuente en estos pacientes es la neumonía asociada a ventilación mecánica (NAVM), con incidencias reportadas más altas que en la época pre-COVID. El objetivo de este estudio es reportar la incidencia, tasa de incidencia y microbiología de la NAVM en pacientes en VMI con COVID-19. Métodos: Se incluyeron a todos los pacientes con neumonía grave y PCR (+) para SARS-CoV-2 que ingresaron y requirieron VMI entre marzo y julio del 2021 en el Instituto Nacional del Tórax (INT). Se recolectaron datos demográficos, clínicos y de laboratorio de la ficha electrónica. Se registraron y caracterizaron los casos de neumonía asociado a la ventilación mecánica. Resultados: Se incluyeron 112 pacientes de los cuales el 42,8% presentó NAVM, con una tasa de incidencia de 28,8/1.000 días de VMI. Los microorganismos aislados más frecuentes fueron Klebsiella pneumoniae (29,6%), Staphylococcus aureus (21,8%) y Pseudomonas aeruginosa (12,5%). Los pacientes que cursaron NAVM estuvieron casi el doble de tiempo en VMI, pero sin presentar aumento de la mortalidad. Conclusión: La NAVM es una complicación frecuente en los pacientes con neumonía grave asociada a COVID-19. La microbiología de estas entidades no ha cambiado respecto a la era pre-pandémica. Estos resultados cobran relevancia en el inicio y suspensión de antibióticos en este grupo de pacientes.

Introduction: Patients with COVID-19 can progress to severe acute respiratory failure and require invasive mechanical ventilation (IMV). The most frequent complication in these patients is ventilator-associated pneumonia (VAP), with higher reported incidences than in the pre-COVID era. The objective of this study is to report the prevalence, incidence rate and microbiology of VAP in patients on IMV with COVID-19. Methods: Patients with severe pneumonia and PCR (+) for SARS-CoV-2 who were admitted to IMV between march and july 2021 at the Instituto Nacional del Tórax (Chile) were included. Demographic, clinical and laboratory data from electronic records were collected. Cases of pneumonia associated with mechanical ventilation were recorded and characterized. Results: 112 patients were included, 42.8% of them presented VAP with an incidence rate of 28.8/1,000 IMV days. The most frequent isolated microorganisms were Klebsiella pneumoniae (29.6%), Staphylococcus aureus (21.8%) and Pseudomonas aeruginosa (12.5%). Patients who underwent VAP spent almost twice as long on IMV, although they had not increase in mortality. Conclusion: VAP is a common complication in patients with severe pneumonia associated with COVID-19. The microbiology of these entities has not changed from the pre-pandemic era. These results become relevant in the initiation and suspension of antibiotics in this group of patients.

Caracterización clínica y microbiológica de pacientes con trazas en Xpert MTB/RIF Ultra / Clinical and microbiological characterization of patients with Xpert MTB/RIF Ultra traces

INTRODUCCIÓN: El Xpert MTB/RIF Ultra (Ultra) ha mejorado dramáticamente el diagnóstico de la tuberculosis (TBC). Con él ha nacido la categoría de trazas, que es la menor carga bacilar detectable por este examen. OBJETIVO: Describir las características clínicas de los pacientes con presencia de trazas en el Ultra y evaluar la confirmación de la TBC como diagnóstico clínico. MATERIALES Y MÉTODOS: Estudio descriptivo de serie de casos. Se extrajo la información de fichas clínicas de pacientes con positividad a trazas. Se confrontaron datos clínicos, microbiológicos e histopatológicos. RESULTADOS: Se analizaron 21 pacientes. La edad promedio fue de 52 años. Todos los casos presentaron baciloscopias negativas. Cuatro cultivos en medio líquido MGIT fueron positivos, dos en pleura parietal, uno en líquido pleural y otro en expectoración. En pleura parietal, tres casos presentaron granulomas con necrosis caseosa y un granuloma esbozos de necrosis. En tejido pulmonar se observaron dos casos con granulomas con esbozos de necrosis y dos con granulomas no necrotizantes. Tres pacientes tenían el antecedente de TBC previa, se interpretó la positividad de trazas en ellos como falsos positivos. Finalmente se diagnosticaron 13 casos como TBC activa, donde cinco de ellos fueron TBC pleurales. La mayor concordancia clínica, microbiológica e histopatológica fue en muestras de líquido y tejido pleural. DISCUSIÓN: Se debe interpretar con cautela los hallazgos de esta prueba en muestras de vía aérea; el análisis multidisciplinario (clínica, imágenes, microbiología, histología) es crucial en las decisiones de nuestras conductas clínicas futuras. El hallazgo de trazas en pleura tiene, a nuestro parecer, un alto valor diagnóstico en el estudio de la tuberculosis en esta localización.

INTRODUCTION: Xpert MTB/RIF Ultra has dramatically changed the diagnosis of tuberculosis. A new category called traces appeared, which is the smallest amount of bacillar load detectable. OBJECTIVE: Describe the clinical characteristics of patients that present traces in Xpert MTB/RIF Ultra test, and to evaluate the confirmation of tuberculosis as clinical diagnosis. METHODS: We perform a descriptive case series study. Information was recovered from clinical records of patients with positive test for traces. Clinical, histopathological and microbiological results were confronted. RESULTS: Twenty one patients were analyzed. The mean age was 52 years-old. All cases had negative smear microscopy and four MGIT cultures were positive, two in pleural fluid and another in sputum. In parietal pleura, three cases presented granulomas with caseous necrosis, and one showed granuloma with very little necrosis. In pleural tissue we observed two cases of granulomas with traces of necrosis and two with non-necrotizing granulomas. Three patients had history of previous tuberculosis and positive traces, the test was interpreted as a false positive result. Finally, active tuberculosis was diagnosed in 13 cases, and five of them were pleural tuberculosis. The highest clinical, microbiological and histopathological agreement was in fluid and pleural tissue samples. DISCUSSION: The findings of Xpert MTB/RIF Ultra in airway samples must be interpreted carefully. Multi-disciplinary analysis is crucial in future clinical decisions. The finding of traces in pleura has, in our opinion, a high diagnostic value in the study of tuberculosis in this location.

Biomarcadores en tuberculosis / Biomarkers in tuberculosis

Resumen Los métodos diagnósticos clásicos para la tuberculosis son de baja sensibilidad o son muy lentos en la obtención de resultados (baciloscopía, cultivo de Koch). De ahí nace la necesidad de nuevos métodos diagnósticos para esta enfermedad. Los biomarcadores surgen como una opción a esta problemática, con un buen rendimiento diagnóstico, costo y accesibilidad. Ellos permiten identificar la respuesta inflamatoria y/o metabólica del huésped, extrapolando la presencia de Mycobacterium tuberculosis; o identifican moléculas propias del patógeno. En la presente revisión se describen biomarcadores que presentan un buen rendimiento diagnóstico basados en metodologías de investigación de alto nivel (estudio de cohortes, prospectivos, muestreo consecutivo o aleatorizado, comparación de rendimiento diagnóstico frente a cultivo). Es necesario el desarrollo de estas nuevas técnicas con el fin de realizar el diagnóstico precoz de la enfermedad y lograr así su tan ansiada eliminación.

The classical laboratory diagnostic methods for tuberculosis have a low sensitivity or take a long time to know their results. New methods are underway. Biomarkers are a good option to improve our diagnostic approach to this disease. They have good performance, low cost and accessibility. They identify a patient's inflammatory or metabolic response to Mycobacterium Tuberculosis or identifies molecules that are typical of the pathogen. In this paper we sum up the biomarkers with a good diag-nostic performance described in well design investigations. Early diagnosis with these new techniques should contribute to the elimination of the disease.